При простейшем однородном подборе достаточно разделить в процессе бонитировки всё стадо на три основные группы:
1) отборная группа (в племенных хозяйствах это будет так называемая элита, а в остальных — племенное ядро);
2) основное стадо («классное» в племенных хозяйствах и пользовательное в неплеменных);
3) брак.
В первую, отборную группу выделяют всех животных, как самцов, так и самок, желательного типа по формам телосложения и по продуктивности. Всех отборных самок спаривают с наилучшими из этой же отборной группы самцами-производителями, а при нехватке таковых применяют искусственное осеменение.
В основное стадо выделяют животных менее совершенных, несколько уклоняющихся от желательного типа, но с достаточно правильным и крепким телосложением и удовлетворительной продуктивностью. Маточное поголовье этой группы должно идти в случку с производителями первой отборной группы. Самцов же, выделенных в основное стадо, лучше в хозяйстве не использовать; лучших из них можно передать в другие хозяйства с менее ценными стадами или оставить в качестве пользовательных животных.
В третью группу — брака, выделяют животных с явно порочным экстерьером, недоразвитых, низкопродуктивных, старых, больных и т. д. Самок этой группы выбраковывают на продажу или откармливают на мясо, а самцов кастрируют либо для использования на работах (волы, мерины), либо для откорма на мясо (волы, бараны), либо для получения шерсти (валухи), а совсем негодных самцов выбраковывают.
Проводя систематически из года в год, из поколения в поколение эту работу, можно всё стадо или большую часть стада перевести в отборную группу. Повышая с каждым годом требования к животным (во время бонитировки) и более жёстко выбраковывая нежелательные экземпляры, можно всё больше и больше совершенствовать, улучшать всё стадо. В отборной части стада применяют наиболее строгий отбор и индивидуальный подбор, основанный на всестороннем изучении как особенностей телосложения, продуктивности, плодовитости, так и происхождения каждого животного и качества его потомства. При этом применяют разведение по линиям, т. е. в пределах родственной группы животных, имеющих общего отдалённого родоначальника, подбирают для спаривания такие пары, которые имеют наибольшее сходство с выдающимся родоначальником и в наибольшей мере приближаются по характеру телосложения и производительности к желательному типу.
Разведение по линиям не может ограничиться подбором и спариванием животных, взятых из одной линии. Часто лучшие результаты получаются при межлинейных скрещиваниях. Поэтому наряду с подбором в пределах одной линии следует испытывать и различные межлинейные скрещивания; найдя наиболее удачно сочетающиеся линии, в дальнейшем следует широко использовать межлинейные скрещивания наиболее удачно сочетающихся линий. Как отмечалось выше, при разведении по линиям приходится прибегать к спариванию родственных животных, но родство это должно быть не слишком близким; повторяющийся в родословной общий предок должен быть не ближе третьего — четвертого ряда предков.